蛇?蝙蝠?水貂?新型冠狀病毒究竟來源於哪種動物?

與往年相比,2020年的這個春節,實在是太難了。

2019年的冬天,來自武漢的一種新型冠狀病毒悄然滋生,伴隨着春運的“大遷徙”,迅速蔓延到了全國各地。

據國家衞健委通報,截至1月29日24時,累計報告確診病例7711例,現有重症病例1370例,累計死亡病例170例,累計治癒出院病例124例,共有疑似病例12167例。短短一個月時間,新型冠狀病毒肺炎疫情的確診病例已超過2003年的SARS疫情。

不斷上升的數字,牽動着全國人民的心。疫情之下,除了要做好隔離和救治,找到“病毒源頭”也同樣重要。

儘快確認病毒的源頭宿主和中間宿主,可以加快針對該病毒藥物與疫苗的研發,迅速阻斷人與病原體的接觸,對於病毒病原體早期預防和疫情控制的意義,不言而喻。

新型冠狀病毒來源於“野味”

2020年1月7日,武漢肺炎病原體初步判定為新型冠狀病毒,經測序,獲得其全基因組序列,隨後得到公佈。

1月20日,國家衞健委高級別專家組組長、中國工程院院士鍾南山在採訪中表示,從各方面的流行病學的調查看,這次疫情的源頭來自一個野生動物,比如説竹鼠、獾這類。

1月22日,中科院院士、中國疾病預防控制中心主任高福表示,此次新型冠狀病毒來自於武漢一家海鮮市場非法銷售的野生動物。
經過調查,專家很快鎖定了武漢華南海鮮市場,雖以海鮮市場冠名,但其實際上卻是個綜合市場。據了解,這個市場存在多家野生動物交易商鋪,也就是所謂的“野味”。


1月26日,中國疾控中心病毒病所首次從華南海鮮市場的585份環境樣本中,檢測到33份樣品含有新型冠狀病毒核酸,併成功在陽性環境標本中分離病毒,提示該病毒來源於華南海鮮市場銷售的野生動物,但研究並未鎖定是哪一種具體的動物。

新型冠狀病毒流行源自蛇?遭學界質疑

據雷鋒網此前報道,1月22日,一篇發表在Journal of Medical Virology(醫學病毒雜誌)的論文指出,與刺蝟、穿山甲等其他動物相比,2019-nCoV的密碼子使用偏好與蛇類似,因此蛇最有可能是攜帶新型冠狀病毒的動物。


不過,這樣的消息很快得到了學界的質疑:科學媒體“知識分子”商周專欄在23日發表文章稱,“此前流行的SARS和MERS病毒的自然宿主均是蝙蝠,通過果子狸和駱駝傳染給人,也就是説,病毒的傳遞是在哺乳動物之間進行的。但蛇不是哺乳動物,而是爬行類。”


聖保羅大學的病毒學家Paulo EduardoBrandão説:“他們沒有證據表明蛇可以被這種新的冠狀病毒感染並作為宿主。除了哺乳動物和Aves(鳥類)以外,沒有一致的證據證明宿主中存在冠狀病毒。”

蝙蝠、水貂成候選?

1月24日,北京大學工學院教授朱懷球團隊在bioRxiv預印版平台發表題為《深度學習算法預測新型冠狀病毒的宿主和感染性》的文章。基於深度學習算法開發的VHP(病毒宿主預測)方法,推測出蝙蝠和水貂可能是新型冠狀病毒的兩個潛在宿主,水貂可能為病毒傳播的中間宿主。


文中提到,隨着全基因組序列的在線發佈,他們預測了新型冠狀病毒2019-nCoV的潛在宿主。結果顯示,2019-nCoV的6個基因組均具有較高(p值VHP法提供的50種冠狀病毒潛在宿主的P值(人類冠狀病毒呈紅色,2019-NCoV標記為*)


新型冠狀病毒與44種病毒進化樹(橙色區域為2019-NCoV)

朱懷球團隊研究得出結論,新型冠狀病毒具有與嚴重急性呼吸綜合徵冠狀病毒(SARS-CoV)、蝙蝠SARS樣冠狀病毒(Bat SARS-like CoV)和中東呼吸綜合徵冠狀病毒(MERS-CoV)類似的感染人類的強大潛力。

與感染其他脊椎動物的冠狀病毒相比,蝙蝠冠狀病毒具有與武漢新型冠狀病毒,即2019-nCoV相似的感染模式。此外,通過比較所有宿主在脊椎動物上的病毒傳染模式,發現水貂病毒的傳染性模式與2019-nCoV更為接近。

該課題組成員之一,浙江大學醫學院第一醫院、傳染病診治國家重點實驗室副主任肖永紅對媒體表示,研究發現,新型冠狀病毒與其他冠狀病毒有相似的傳染過程。蝙蝠身上有多種冠狀病毒,這些冠狀病毒可能先傳染至哺乳動物,再傳染到人。比如MERS病毒,中間宿主就是駱駝。對於新型冠狀病毒來説,研究預測,蝙蝠是它的最主要來源,中間宿主可能是水貂。

需要指出的是,這一研究並非是基於動物實體的研究,只是採用計算機深度學習算法來進行的數據模式推論,準確性有待商榷。

值得注意的是,23 日,中國科學院武漢病毒研究所石正麗團隊在 bioRxiv 預印版平台上發文稱,新型冠狀病毒(2019-nCoV)或來源於蝙蝠。


據了解,石正麗團隊早期從5名患者體內獲得了該病毒的全基因組,其中這5例基因組基本上一致,並與SARS-CoV的序列一致性達79.5%。同時還發現,2019-nCoV與雲南菊頭蝠中存在的RaTG13冠狀病毒的序列一致性高達96.2%。

另外,早前21日,中國科學院上海巴斯德研究所郝沛研究員、軍事醫學研究院國家應急防控藥物工程技術研究中心鍾武研究員和中科院分子植物卓越中心合成生物學重點實驗室李軒研究員合作,在SCIENCE CHINA Life Sciences(中國科學:生命科學)上發表論文稱,武漢冠狀病毒和SARS/類SARS冠狀病毒的共同祖先都是和HKU9-1類似的病毒。並推測和SARS一樣,武漢冠狀病毒的自然宿主也可能是蝙蝠,在從蝙蝠到人的傳染過程中很可能存在未知的中間宿主媒介。

蝙蝠:病毒之王

從目前的幾路研究來看,傾向於認為新型冠狀病毒的源頭宿主疑似為蝙蝠,但病毒的中間宿主是什麼,仍不明晰。


蝙蝠身上攜帶超過100多種兇險無比的致病性病毒,被稱為“大自然的活體病毒庫”,是真正的病毒之王。許多著名病毒的自然宿主都被證實為蝙蝠。比如埃博拉病毒、尼帕病毒、亨德拉病毒、MERS病毒、SARS病毒等,均被證實蝙蝠為最初的病毒“元兇”。

為什麼蝙蝠會攜帶那麼多病毒?

蝙蝠是一個古老的物種,是最早的哺乳動物之一,有5000萬年的進化史,漫長的進化過程使得蝙蝠發展出了超強的DNA損傷修復能力,逆天的免疫系統造就了蝙蝠“百毒不侵”的防禦功能,雖然攜帶多種病菌,但自身生命力卻極其頑強。且其物種繁多,數量龐大,目前已知的蝙蝠種類近1200種,佔了全球哺乳動物總量的五分之一。而且蝙蝠還是除人類之外分佈範圍最廣的哺乳類動物羣,幾乎無處不在。同時,蝙蝠作為唯一會飛的哺乳動物,活動範圍強大,而且以羣居生活為主,這就導致其接觸和傳播病毒的機會大大增加,這也讓很多野生動物成為了病毒的中間宿主。

2003年SARS時期,專家從廣東野生動物市場上售賣的果子狸體內分離和檢測到了和SARS病毒完全一樣的病毒。然而,專家調查了全國各地的養殖果子狸和野生果子狸,卻發現它們並沒有被SARS病毒感染的證據。13年之後,中國科學院武漢病毒研究所石正麗組和崔傑組在SARS冠狀病毒起源獲得突破性進展,終於在雲南昆明地區一個小山洞裏的蝙蝠身上發現了SARS病毒所有基因組成,證實了SARS病毒的源頭就是蝙蝠。

微博網友@|荷莊|表示:蝙蝠憑一己之力,封印了病毒千年,晝伏夜出,努力扮演一個孤獨的潘多拉盒子,並且已經盡到最大努力長得不像個食材,萬萬還是沒想到,這生生世世的努力,終究是錯付了……


雷鋒網(公眾號:雷鋒網)小結:

雖説這次新型冠狀病毒的宿主還沒有最終明確,但可以肯定的是,依然和野生動物有關。這場突如其來的疫情,給我們的教訓,已經足夠深刻了。

1月26日,市場監管總局、農業農村部、國家林草局已禁止野生動物交易活動,直至全國疫情解除。

不過,大家也無需過度恐慌,相信在全國人民齊心協力的支持和幫助下,疫情終究會被戰勝。鍾南山院士表示,這次病毒雖然傳染性比較強,但病死率不是特別高。當年SARS持續了五六個月,相信這個新型冠狀病毒不會持續那麼長。現在要抓住兩個要害:早發現,早隔離,這是最原始也是最有效的辦法。

在這裏,雷鋒網編輯提醒大家,為了自己和他人的身體健康,請珍愛生命,遠離“野味”。同時,沒有特殊情況儘量減少外出,外出的話記得戴口罩,勤洗手、勤消毒,做好防護措施。

參考來源: bioRxiv 、inature、 MedSci梅斯、知識分子、新京報、新華網

參考鏈接:

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.21.914044v2

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jmv.25682

https://mp.weixin.qq.com/s/NZoHBBzIgSWMlAVNacFTaw

https://xw.qq.com/cmsid/20200125A0CB0R00

http://www.xinhuanet.com/2020-01/27/c_1125504355.htm

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資料來源:雷鋒網
作者/編輯:李菁瑛

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